- 日治時期即有規劃。
1937年12月27日指定「新高・阿里山」（玉山—阿里山）、「次高・タロコ」（雪山—太魯閣）、「大屯」等三處為國立公園。1941年擱置
- 主管機關：內政部營建署(國家公園法)。
未來將隨著行政院組織改造改由內政部屬下的國家公園署管理。
- 管理：大部分的國家公園設有管理處以專責管理
東沙環礁國家公園與澎湖南方四島國家公園因同樣定位為海洋國家公園，而合設海洋國家公園管理處管轄。
- 目前數量：9
- 第一：墾丁
最新：澎湖南方四島 (澎湖縣東吉嶼、西吉嶼、東嶼坪嶼、西嶼坪嶼等「南方四島」及周邊島礁、海域
- 最大：東沙環礁國家公園 (高雄市)
最小：金門國家公園
- 規劃中：北方三島海洋國家公園 （包含彭佳嶼、棉花嶼、花瓶嶼，考慮可能擴大涵蓋基隆嶼）
- 擱置中：
棲蘭（馬告檜木）國家公園：台灣世界遺產潛力點，扁柏為主。因峰高、谷深、雨霧足，形成孤島式的封閉性生態環境，使得伴生於檜木林帶之珍稀裸子植物，如紅豆杉、臺灣杉、巒大杉、臺灣粗榧等北極第三紀孑遺植物，因長期隔離演化，形成臺灣僅有的特有種，而這些特有種針葉類珍稀裸子植物群，歷經數千萬年至上億年的演替，堪稱「活化石樹」，在生態演化上具有指標地位，符合世界遺產登錄標準第八項。
能丹國家公園：中央山脈中高海拔，能高山和丹大山區。布農、泰雅居住地，布農族人反對
綠島國家公園：居民反對
蘭嶼國家公園：居民及達悟族人反對。海洋國家公園管理處另於2011年8月成立蘭嶼海洋文化資源保育推廣中心，推動蘭嶼當地的海洋文化與資源保育工作。
國家自然公園（面積較小）